理系女子博士・朝仓由纪は、ある日突然、古代の世界へと転生してしまう。目を覚ますや否や命を狙われ、逃亡の途中で瀕死の少年を助ける。孤独な迷子だと思い、「ワンちゃん」と名付けるが、実は彼こそ陰謀により幼児化させられた大将軍・葵隼人だった！ 事情を知らない由纪は、彼を弟のように世話するが、隼人は屈辱に耐えながらも正体を隠し続ける。しかし、共に過ごすうちに、次第に彼女に特別な感情を抱くようになっていく……。 やがて隼人が元の姿に戻るも、彼女はまったく怖がることなく、むしろ堂々と指図してくる！？ なのに、なぜかそれが心地よく感じてしまう自分がいる。そんな中、異国の姫君の登場により、二人の関係は新たな波乱へと巻き込まれていく。